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量子化学计算(Gausssian)图形工作站硬件方案

来源:互联网 2023-02-20 18:13:35 357

由于分子的类型、体系和模拟算法,以及各种应用和精度要求,都有不同的计算特点,对计算机硬件(CPU、内存、硬盘、GPU)配置要求有很大的差异 ,那么如何选择好服务器/工作站的硬件配置,提高计算速度,缩短求解时间?52h办公区 - 实用经验教程分享!

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工具/原料

  • UltraLAB图形工作站
  • 主要量子化学软件:Gaussian,GAMESS,MOLPRO,NWChem

以Gaussian为例,先看多核并行计算测试

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    基于Gaussian 09版本52h办公区 - 实用经验教程分享!

    分别用4核、8核、16核、32核、64核进行求解,从计算结果看,多核并行加速比很理想52h办公区 - 实用经验教程分享!

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    基于Gaussian 16版本多核并行计算测试52h办公区 - 实用经验教程分享!

    分别用8核、16核、32核、44核进行求解,从计算结果看,多核并行加速比到32核很理想,44核已经对求解没有多大提升了52h办公区 - 实用经验教程分享!

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    量子化学算法、精度与计算成本52h办公区 - 实用经验教程分享!

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  • 3本页面非法爬取自百度经验
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    原子体系规模、算法及硬件配置特点52h办公区 - 实用经验教程分享!

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  • 量子化学计算硬件配置特点

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    (1)不同算法的并行计算的核数加速比有所差异,不完全是线性的52h办公区 - 实用经验教程分享!

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    (2)最新CPU架构和提升频率,对缩短求解时间非常显著52h办公区 - 实用经验教程分享!

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    (3)精度高求解计算量大,对CPU频率和核数、内存容量、硬盘io要求均有很高要求52h办公区 - 实用经验教程分享!

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    (4)核数与内存比例为 1:4最为理想52h办公区 - 实用经验教程分享!

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    (5)支持Tesla K40或K80 的GPU计算,显存需12GB以上,但算法有局限性,同时性价比不好52h办公区 - 实用经验教程分享!

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    (6)组成集群的计算节点配置最好采用4核~10核超高频,效率最高52h办公区 - 实用经验教程分享!

  • 基于量子化学计算,UltraLAB图形工作站分析

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    • 与市场常规机型配置相比,UltraLAB工作站提供的CPU频率和存储io更高,配置均衡合理,保证了机器硬件性能最大化,求解时间更短。52h办公区 - 实用经验教程分享!

    注意事项

    • (1)全部采用最新intel硬件架构
    • (2)提供不用规模的高效完美硬件配置,满足不同算法和精度计算需求
    • (3)每个配置架构,CPU频率达到极致,提升性能关键指标
    • (4)足够多核数,并行存储高io,满足高精度计算,均衡无死角
    • (5)整机全部提供系统优化,大幅提升计算速度
    • (6)支持GPU计算扩展

    以上方法由办公区教程网编辑摘抄自百度经验可供大家参考!52h办公区 - 实用经验教程分享!


    标签: 硬件图形工作方案量子化学

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